
Suomen Lääketieteen Säätiö on perustanut seuraavat erikoisrahastot saamiensa merkittävien lahjoitusten johdosta:
- Alkoholitutkimusrahasto 2001
- Aino Eerolan rahasto 1973
- Arkkiatri Risto Pelkosen 90-vuotisjuhlarahasto 2021
- Roland, Marita ja Patricia Freundin rahasto 2011
- Sinikka ja Seppo Heikkilän rahasto 2003
- Kliinisen kemian tutkimussäätiön rahasto 1967
- T W Lilljan säätiön rahasto 2018
- Lääketehdas Orionin tieteellinen tutkimusrahasto 1966
- Anna-Kaisa Nikalin rahasto 2019
- Aarno ja Jenny Piponiuksen rahasto 1986
- Paavo ja Veikko Pirilän rahasto 1978
- Planmeca-Planmed rahasto 2010
- Pohjolan ja Suomi-yhtiöiden rahasto 1984
- Teemu Pohjanpellon rahasto 1986
- Tauno Putkosen rahasto 1973
- Eero Matti Ranisen rahasto 2008
- Aili Turusen rahasto 2014
- Maija ja Matti Vaskion rahasto 1960
- A. E. Vehmaksen rahasto 2006
- Winthrop-lääkeyhtymän tutkimusrahasto 1966