Suomen Lääketieteen Säätiön toiminnan tavoite on suomalaisen lääketieteellisen tutkimustyön ja koulutuksen tukeminen. Säätiö on Säätiöt ja rahastot ry:n jäsen ja noudattaa toiminnassaan Hyvää säätiötapaa.
Säätiön toimintaa ohjaa neuvottelukunta. Siihen kuuluu 12 jäsentä, joista kahdeksan on oltava Suomalaisen Lääkäriseuran Duodecimin jäseniä. Neuvottelukunnan jäsenet valitaan tehtäväänsä kolmeksi vuodeksi kerrallaan ja heidät voidaan valita enintään kaksi kertaa peräkkäin.
Neuvottelukunta valitsee säätiön hallituksen. Hallitukseen kuuluu 6 jäsentä, joista vähintään kolmen on oltava Duodecim-seuran jäsen. Hallituksen jäsenen toimikausi on kolme vuotta. Sama henkilö voidaan valita uudelleen hallitukseen enintään kaksi kertaa peräkkäin.
Säätiön hallitus johtaa säätiön toimintaa, valvoo säätiön omaisuuden hankintaa ja hoitoa sekä valmistelee tärkeät taloudelliset ja muut kysymykset. Apurahojen ja palkintojen jaosta päättää hallitus.
Pj. Katriina Aalto-Setälä
hallituksessa vuodesta 2023
synt. 1960, professori Tampereen yliopisto
Juhani Knuuti
hallituksessa vuodesta 2024
professori, Turun yliopisto, TYKS, PET-keskuksen johtaja
Taneli Raivio
hallituksessa vuodesta 2024
synt. 1970, professori Helsingin yliopisto, HUS, tutkimusjohtaja
Vpj. Susanna Korpivaara
hallituksessa vuodesta 2019
synt. 1972, VTM, MBA
Toimitusjohtaja, Rud Pedersen
Elmar Paananen
hallituksessa vuodesta 2023
synt. 1965, KTM, VN
Toimitusjohtaja Troll Capital Oy
Ira van der Pals
hallituksessa vuodesta 2022
synt. 1972, KTM
Sijoitusjohtaja, Kirkon eläkerahasto
Käytännön asioita hoitavat säätiön osapäivätoimiset asiamies ja sihteeri.
Asiamies, DI, MBA Jouni Lounasmaa
Viestintäpäällikkö, VTM Ilmari Tuomivaara
Sihteeri, HSO Marketta Kaunisto